Agent-almanac create-r-package

install
source · Clone the upstream repo
git clone https://github.com/pjt222/agent-almanac
Claude Code · Install into ~/.claude/skills/
T=$(mktemp -d) && git clone --depth=1 https://github.com/pjt222/agent-almanac "$T" && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r "$T/i18n/zh-CN/skills/create-r-package" ~/.claude/skills/pjt222-agent-almanac-create-r-package-6700df && rm -rf "$T"
manifest: i18n/zh-CN/skills/create-r-package/SKILL.md
source content

创建 R 包

使用现代工具链和最佳实践搭建配置完善的 R 包。

适用场景

  • 从零开始创建新的 R 包
  • 将零散的 R 脚本整理为包
  • 为协作开发搭建包骨架

输入

  • 必需:包名(小写,除
    .
    外不含特殊字符)
  • 必需:包用途的一句话描述
  • 可选:许可证类型(默认:MIT)
  • 可选:作者信息(姓名、邮箱、ORCID)
  • 可选:是否初始化 renv(默认:是)

步骤

第 1 步:创建包骨架

usethis::create_package("packagename")
setwd("packagename")

预期结果: 创建包含

DESCRIPTION
NAMESPACE
R/
man/
子目录的目录。

失败处理: 确保已安装 usethis(

install.packages("usethis")
)。检查目标目录是否已存在。

第 2 步:配置 DESCRIPTION

编辑

DESCRIPTION
填入准确的元数据:

Package: packagename
Title: What the Package Does (Title Case)
Version: 0.1.0
Authors@R:
    person("First", "Last", , "email@example.com", role = c("aut", "cre"),
           comment = c(ORCID = "0000-0000-0000-0000"))
Description: One paragraph describing what the package does. Must be more
    than one sentence. Avoid starting with "This package".
License: MIT + file LICENSE
Encoding: UTF-8
Roxygen: list(markdown = TRUE)
RoxygenNote: 7.3.2
URL: https://github.com/username/packagename
BugReports: https://github.com/username/packagename/issues

预期结果: 有效的 DESCRIPTION 文件,通过

R CMD check
且无元数据警告。

失败处理: 如果

R CMD check
对 DESCRIPTION 字段发出警告,请确认
Title
使用标题大小写、
Description
超过一句话、
Authors@R
使用有效的
person()
语法。

第 3 步:搭建基础设施

usethis::use_mit_license()
usethis::use_readme_md()
usethis::use_news_md()
usethis::use_testthat(edition = 3)
usethis::use_git()
usethis::use_github_action("check-standard")

预期结果: 创建 LICENSE、README.md、NEWS.md、

tests/
目录、初始化
.git/
,以及创建
.github/workflows/

失败处理: 如果任何

usethis::use_*()
函数失败,安装缺失的依赖后重新运行。如果
.git/
已存在,
use_git()
将跳过初始化。

第 4 步:创建开发配置

创建

.Rprofile

if (file.exists("renv/activate.R")) {
  source("renv/activate.R")
}

if (requireNamespace("mcptools", quietly = TRUE)) {
  mcptools::mcp_session()
}

创建

.Renviron.example

RSTUDIO_PANDOC="C:/Program Files/RStudio/resources/app/bin/quarto/bin/tools"
# GITHUB_PAT=your_github_token_here

创建

.Rbuildignore
条目:

^\.Rprofile$
^\.Renviron$
^\.Renviron\.example$
^renv$
^renv\.lock$
^CLAUDE\.md$
^\.github$
^.*\.Rproj$

预期结果: 创建

.Rprofile
.Renviron.example
.Rbuildignore
。开发文件被排除在构建包之外。

失败处理: 如果

.Rprofile
在启动时报错,检查语法问题。确保
requireNamespace()
保护在可选包缺失时不会导致失败。

第 5 步:初始化 renv

renv::init()

预期结果: 创建

renv/
目录和
renv.lock
。项目本地库已激活。

失败处理: 使用

install.packages("renv")
安装 renv。如果 renv 在初始化时卡住,检查网络连接或设置
options(timeout = 600)

第 6 步:创建包文档文件

创建

R/packagename-package.R

#' @keywords internal
"_PACKAGE"

## usethis namespace: start
## usethis namespace: end
NULL

预期结果:

R/packagename-package.R
存在并包含
"_PACKAGE"
标记。运行
devtools::document()
可生成包级帮助文档。

失败处理: 确保文件名符合

R/<packagename>-package.R
模式。
"_PACKAGE"
字符串必须是独立表达式,不能放在函数内部。

第 7 步:创建 CLAUDE.md

在项目根目录创建

CLAUDE.md
,包含面向 AI 助手的项目专属说明。

预期结果: 项目根目录存在

CLAUDE.md
,包含项目专属的编辑约定、构建命令和架构说明。

失败处理: 如不确定应包含哪些内容,先写上包名、一句话描述、常用开发命令(

devtools::check()
devtools::test()
)以及任何不明显的约定。

验证清单

  • devtools::check()
    返回 0 错误、0 警告
  • 包结构符合预期布局
  • .Rprofile
    加载无错误
  • renv::status()
    无异常
  • Git 仓库已初始化并配置了合适的
    .gitignore
  • GitHub Actions 工作流文件存在

常见问题

  • 包名冲突:提交名称前用
    available::available("packagename")
    检查 CRAN 上是否已存在同名包
  • 缺少 .Rbuildignore 条目:开发文件(
    .Rprofile
    .Renviron
    renv/
    )必须排除在构建包之外
  • 忘记 Encoding:DESCRIPTION 中始终包含
    Encoding: UTF-8
  • RoxygenNote 版本不匹配:DESCRIPTION 中的版本必须与已安装的 roxygen2 版本一致

示例

# 最简创建
usethis::create_package("myanalysis")

# 在一个会话中完成全部设置
usethis::create_package("myanalysis")
usethis::use_mit_license()
usethis::use_testthat(edition = 3)
usethis::use_readme_md()
usethis::use_git()
usethis::use_github_action("check-standard")
renv::init()

相关技能

  • write-roxygen-docs
    - 为创建的函数编写文档
  • write-testthat-tests
    - 为包添加测试
  • setup-github-actions-ci
    - 详细的 CI/CD 配置
  • manage-renv-dependencies
    - 管理包依赖
  • write-claude-md
    - 编写有效的 AI 助手说明