Agent-almanac interpret-chromatogram
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T=$(mktemp -d) && git clone --depth=1 https://github.com/pjt222/agent-almanac "$T" && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r "$T/i18n/es/skills/interpret-chromatogram" ~/.claude/skills/pjt222-agent-almanac-interpret-chromatogram-57d4e1 && rm -rf "$T"
i18n/es/skills/interpret-chromatogram/SKILL.mdInterpretar Cromatograma
Extraer información cualitativa y cuantitativa de cromatogramas de GC y HPLC mediante la evaluación de la calidad de la separación, la identificación de picos, la verificación de la integración y la cuantificación de analitos.
Cuándo Usar
- Evaluar la calidad de una separación cromatográfica (resolución, eficiencia, forma de pico)
- Identificar picos por comparación de tiempos de retención con estándares o espectros de referencia
- Cuantificar analitos usando curvas de calibración externas o estándar interno
- Detectar problemas instrumentales o de muestra a partir del perfil del cromatograma
- Verificar la pureza de un pico en métodos HPLC-DAD
Entradas
- Requerido: Cromatograma (señal del detector frente al tiempo)
- Requerido: Tipo de análisis (GC o HPLC) y método utilizado
- Opcional: Estándares de referencia con tiempos de retención conocidos
- Opcional: Datos de calibración para cuantificación
- Opcional: Espectros de pico (DAD para HPLC, MS para GC-MS o LC-MS)
Procedimiento
Paso 1: Evaluar la Calidad General del Cromatograma
Antes de interpretar picos individuales, realizar una evaluación global:
- Verificar la línea base: Debe ser estable y plana en ausencia de picos. Una línea base con deriva (ascendente/descendente) indica: en GC → sangrado de columna o temperatura demasiado alta; en HPLC → sistema no equilibrado o contaminación de la fase móvil.
- Evaluar el ruido de la línea base: Ruido regular periódico → interferencia eléctrica o bomba; ruido aleatorio alto → problemas de detector o muestra. El ruido debe ser < 1% de la señal del pico más pequeño de interés.
- Verificar la presencia del pico del disolvente o frente de disolvente: En GC, el pico del disolvente debe aparecer al principio, bien separado de los analitos. En HPLC, el frente de disolvente (tiempo muerto t0) no debe solapar con el primer pico de analito.
- Comprobar que todos los picos esperados están presentes: Comparar con el cromatograma de referencia o la mezcla estándar. Picos ausentes pueden indicar problemas de preparación de muestra, inyección o pérdidas en el sistema.
- Detectar picos inusuales: Picos extra, hombros o picos muy anchos pueden indicar impurezas, productos de degradación o problemas del sistema.
Esperado: Evaluación documentada de la calidad del cromatograma con la línea base y el ruido evaluados, y todos los picos esperados identificados.
En caso de fallo: Si la calidad del cromatograma es inaceptable (línea base inestable, picos deformados), investigar y corregir el problema instrumental antes de continuar con la interpretación.
Paso 2: Identificar y Asignar Picos
Confirmar la identidad de los picos cromatográficos:
- Comparar tiempos de retención con estándares: La identidad se confirma cuando el t_R del analito en la muestra coincide con el t_R del estándar puro dentro de ± 0.5% (GC) o ± 0.2 min (HPLC) en las mismas condiciones de análisis.
- Calcular el factor de retención k' (o factor de capacidad k):
- k' = (t_R – t_0) / t_0, donde t_0 es el tiempo muerto
- k' debe estar entre 2 y 10 para picos bien retenidos y apropiadamente separados
- Compuestos con k' < 1 pueden coincidir con el frente del disolvente
- Confirmar identidad por espectro (si se dispone de detector espectral):
- GC-MS: Comparar el espectro de masas del pico con la biblioteca NIST; un match score > 85 es indicativo, > 95 es confirmatorio
- HPLC-DAD: Comparar el espectro UV con el del estándar; una coincidencia del espectro normalizado > 99% confirma pureza espectral
- HPLC-MS: Verificar el ion molecular y los fragmentos diagnóstico
- Documentar picos sin identificar: Picos no identificados deben documentarse con su t_R y área relativa; si su abundancia supera el 0.1% del área total, investigar su origen.
Esperado: Tabla de asignación de picos con t_R, k', identidad confirmada y, si aplica, score de coincidencia espectral.
En caso de fallo: Si los tiempos de retención de la muestra y el estándar no coinciden, verificar que el método y las condiciones son idénticos. Diferencias en pH de fase móvil, temperatura o lote de columna pueden desplazar t_R.
Paso 3: Evaluar la Calidad de la Separación
Cuantificar el rendimiento cromatográfico:
- Calcular la resolución Rs:
- Rs = 2 × (t_R2 – t_R1) / (w_b1 + w_b2), donde w_b es el ancho de pico en la base
- Rs ≥ 1.5 indica separación de línea base; Rs ≥ 1.0 indica separación parcial (picos solapados en < 1%)
- Calcular la eficiencia de la columna N (platos teóricos):
- N = 16 × (t_R / w_b)² o N = 5.54 × (t_R / w_0.5)²
- Valores típicos: N ≥ 50 000 para columna de 30 m GC; N ≥ 10 000 para columna HPLC de 150 mm
- Evaluar la simetría del pico (factor de cola):
- As = b / a donde a es la distancia del frente al máximo y b la distancia del máximo a la cola, ambas medidas al 10% de la altura
- As ideal: 0.9–1.2; As > 2.0 indica colas (tailing) por adsorción secundaria; As < 0.7 indica frentes (fronting) por sobrecarga o efecto de solvente
- Identificar pares de picos críticos: El par de picos con Rs mínima determina la adecuación de la separación para su propósito. Documentar Rs para cada par de picos adyacentes.
Esperado: Tabla de parámetros de rendimiento (Rs, N, As) para todos los picos principales, con identificación del par de picos críticos.
En caso de fallo: Si Rs < 1.5 entre picos críticos, implementar las acciones correctivas recomendadas en la skill
troubleshoot-separation.
Paso 4: Verificar y Corregir la Integración
La integración automática requiere verificación manual:
- Comprobar las líneas de integración: El software de integración puede cometer errores con picos solapados, picos sobre hombros o líneas base con deriva. Verificar visualmente que las líneas de integración tienen sentido físico.
- Integrar picos solapados: Usar la función de tangente o de gaussiana del software para separar picos que no están completamente resueltos. Si Rs > 0.8, la integración tangente puede separar las áreas con < 5% de error.
- Verificar la integración de picos pequeños: Los picos cuya altura es < 5× el ruido de la línea base deben integrarse manualmente si el resultado cuantitativo es crítico.
- Documentar las modificaciones de integración: Cualquier cambio manual de la integración automática debe documentarse con justificación en el registro analítico.
- Consistencia de integración: Los mismos parámetros de integración (ancho mínimo de pico, sensibilidad) deben aplicarse a todos los cromatogramas de una serie de análisis para garantizar la comparabilidad.
Esperado: Informe de integración verificado con todas las áreas de pico revisadas y las modificaciones manuales documentadas.
En caso de fallo: Si un pico no puede integrarse correctamente por solapamiento severo (Rs < 0.5), la cuantificación no es fiable con integración estándar. Recurrir a deconvolución matemática de picos o mejorar la separación cromatográfica.
Paso 5: Cuantificar Analitos
Calcular las concentraciones de los analitos a partir de las áreas de pico integradas:
- Calibración externa: Preparar 5–7 estándares en el rango de trabajo; graficar área vs. concentración; verificar linealidad (R² ≥ 0.9995). Calcular la concentración de la muestra por interpolación en la curva.
- Estándar interno: Añadir una cantidad conocida de un compuesto similar (mismo grupo funcional, t_R diferente, no presente en la muestra) a la muestra y al estándar. La ratio área_analito/área_estándar_interno compensa variaciones de inyección.
- Normalización por área: Suma de todas las áreas de pico = 100%; calcular la proporción de cada componente. Válido solo cuando todos los componentes tienen respuesta similar al detector (mismo grupo funcional en GC-FID, mismo cromóforo en HPLC-UV).
- Estándar de adición: Agregar cantidades conocidas del analito a la muestra para construir la curva de calibración en la misma matriz. Compensa efectos de matriz. Requiere al menos 3 niveles de adición.
- Propagar la incertidumbre: Incluir la incertidumbre de calibración, de integración y de preparación de muestra en el resultado final.
Esperado: Resultado cuantitativo con concentración, unidades, incertidumbre expandida y trazabilidad al método de calibración utilizado.
En caso de fallo: Si la curva de calibración no es lineal (R² < 0.999), investigar: exceso de concentración (salir del rango lineal del detector), efecto de matriz, o variabilidad en la preparación de estándares. Considerar calibración con función cuadrática o ampliar el número de puntos de calibración.
Validación
- La línea base y el ruido del cromatograma son aceptables para el análisis
- Todos los picos de interés están identificados con sus t_R y k'
- La resolución Rs ≥ 1.5 entre todos los pares de picos críticos
- La integración ha sido verificada visualmente y documentada
- La curva de calibración muestra R² ≥ 0.9995 en el rango de trabajo
- Los resultados cuantitativos incluyen las unidades y la incertidumbre
Errores Comunes
- No verificar la integración automática: El software de integración puede asignar líneas de integración incorrectas, especialmente en picos solapados o en líneas base con deriva. La verificación visual es obligatoria.
- Comparar tiempos de retención absolutos entre días diferentes: Los t_R varían con la temperatura, el lote de columna y el pH de la fase móvil. Usar tiempos de retención relativos al estándar interno o al patrón de referencia en la misma corrida.
- Usar normalización por área cuando los factores de respuesta son diferentes: En HPLC-UV, compuestos con diferente ε dan áreas muy distintas para la misma concentración. La normalización por área solo es válida cuando todos los analitos tienen respuesta equivalente.
- Ignorar el efecto de matriz en la cuantificación: La matriz de la muestra puede suprimir o potenciar la señal del detector (especialmente en LC-MS con ESI). Si la matriz es compleja, usar estándar de adición o estándar interno análogo.
- Asignar picos solo por tiempo de retención: Un pico en el mismo t_R que un estándar no siempre es el mismo compuesto. Confirmar siempre por espectro (MS o DAD) cuando la identidad sea crítica.
Habilidades Relacionadas
ydevelop-gc-method
— desarrollar el método que produce los cromatogramas a interpretardevelop-hplc-method
— resolver problemas de separación identificados durante la interpretacióntroubleshoot-separation
— validar formalmente el método usando los cromatogramas interpretadosvalidate-analytical-method