Agent-almanac plan-spectroscopic-analysis
git clone https://github.com/pjt222/agent-almanac
T=$(mktemp -d) && git clone --depth=1 https://github.com/pjt222/agent-almanac "$T" && mkdir -p ~/.claude/skills && cp -r "$T/i18n/zh-CN/skills/plan-spectroscopic-analysis" ~/.claude/skills/pjt222-agent-almanac-plan-spectroscopic-analysis-2ff642 && rm -rf "$T"
i18n/zh-CN/skills/plan-spectroscopic-analysis/SKILL.md规划谱学分析方案
通过明确分析目标、样品约束和可用技术,系统规划一套最优的谱学分析序列,以最小化样品消耗并最大化信息获取效率。
适用场景
- 鉴定未知化合物,需要确定最优谱学组合
- 验证合成产物的结构,确定所需实验的最少集合
- 在有限样品量(< 1 mg)的约束下规划分析策略
- 为多步合成项目设计高通量筛选流程
- 将谱学分析工作优先级排序,以高效利用仪器时间
输入
- 必填:分析目标(结构鉴定 / 身份确认 / 纯度检测 / 定量分析)
- 必填:已知的化合物信息(合成路线、天然来源、元素分析等)
- 必填:可用样品量(毫克数)
- 可选:预期官能团(来自合成或文献知识)
- 可选:仪器可用性(哪些技术在本实验室可以使用)
- 可选:时间限制
步骤
第 1 步:明确分析目标类型
不同目标决定不同的分析策略:
| 目标类型 | 典型问题 | 推荐策略 |
|---|---|---|
| 结构鉴定(未知物) | "这是什么化合物?" | 全套谱学:MS → IR → NMR(一维+二维) |
| 结构确认(已知目标) | "是否合成成功?" | 最小集:1H NMR + MS(或 IR) |
| 纯度检测 | "是否含有杂质?" | 1H NMR + HPLC/GC-MS |
| 定量分析 | "浓度是多少?" | UV-Vis(若有发色团)或定量 NMR |
| 官能团确认 | "羰基/羟基存在吗?" | IR(首选快速筛查) |
预期结果: 分析目标明确分类,避免采集不必要的谱图。
失败处理: 若目标不明确,先采集快速且样品消耗少的谱图(如 IR、MS),根据结果再决定进一步的 NMR 分析。
第 2 步:评估样品约束
样品量决定可行的技术选择:
| 样品量 | 可用技术 | 注意事项 |
|---|---|---|
| > 50 mg | 全部技术 | 无特殊限制 |
| 10–50 mg | NMR、IR(ATR)、MS | NMR 可进行二维实验 |
| 1–10 mg | NMR(可能较长时间)、MS、IR-ATR | 13C 和 DEPT 可能需要较长累积时间 |
| 0.1–1 mg | MS(ESI)、微量 NMR | 考虑微量管;IR 和二维 NMR 困难 |
| < 0.1 mg | MS(ESI)、毛细管 NMR | 仅 MS 实际可行 |
溶剂选择(NMR 分析):
- D2O:水溶性化合物(氨基酸、糖、盐)
- CDCl3:大多数有机化合物
- DMSO-d6:难溶化合物、可观察 OH/NH 峰
- CD3CN:中等极性化合物
预期结果: 根据样品量筛除不可行的技术,明确每种技术所需的最低样品量。
失败处理: 若样品量极少(< 1 mg),优先选择 MS 确认分子量,再用微量 NMR 管(1.7 mm 管)尝试 NMR。
第 3 步:选择互补性谱学技术
根据分析目标和样品约束,选择最优技术组合:
技术互补性矩阵:
| 技术 | 主要信息 | 不能提供 | 样品消耗 |
|---|---|---|---|
| 1H NMR | 氢环境、偶合、积分 | 季碳、分子量 | 2–5 mg |
| 13C NMR | 碳骨架 | 精确分子量 | 5–50 mg |
| DEPT | 碳氢化程度 | 同 13C | 同 13C |
| 二维 NMR(COSY/HSQC/HMBC) | 连接性 | 绝对构型 | 5–20 mg |
| IR(ATR) | 官能团(快速) | 分子量、精确结构 | < 1 mg(固体/液体) |
| EI-MS | 分子量、碎片、分子式 | 大分子、热不稳定物 | < 1 mg |
| ESI-MS | 分子量(软电离) | 详细碎片信息 | < 0.1 mg |
| UV-Vis | 共轭体系、浓度 | 非共轭化合物 | < 0.1 mg(溶液) |
| 拉曼 | 对称振动(IR 互补) | 荧光性样品 | 原位、无损 |
推荐的技术组合方案:
-
未知有机小分子(5–20 mg 可用): 顺序:IR-ATR(10 min)→ ESI-MS 或 EI-MS(30 min)→ 1H NMR(30 min)→ 13C/DEPT(2–4 h)→ HSQC(2 h)→ HMBC(4 h)→ COSY(2 h)
-
合成产物的快速确认(1–5 mg 可用): 顺序:1H NMR(30 min)→ ESI-MS(10 min)
-
定量分析(含发色团): 顺序:UV-Vis 标准曲线(1 h)→ 样品测定(10 min/样)
预期结果: 已选择一套最优技术组合,按信息量/样品消耗比最优的顺序排列。
失败处理: 若推荐的技术在本实验室不可用,列出替代方案(如用 GC-MS 代替 EI-MS;用 FTIR 透射代替 ATR-IR)。
第 4 步:确定分析序列(信息效率最优)
将技术按"最大化早期信息获取,最小化样品消耗"的原则排序:
- 首先:无损或微量技术(IR-ATR、MS)
- 其次:快速一维 NMR(1H),指导后续实验
- 然后:根据一维结果决定是否需要 13C/DEPT
- 最后:按需采集二维谱(COSY → HSQC → HMBC)
决策树(NMR 层面):
1H NMR 是否足以完成鉴定? ├─ 是(纯化合物,已知目标)→ 结束 └─ 否 → 是否需要碳骨架信息? ├─ 是 → 采集 13C + DEPT │ └─ 是否有季碳或复杂连接? │ ├─ 是 → 采集 HMBC │ └─ 邻位连接是否不清?→ 采集 COSY └─ 否(仅需确认官能团)→ IR 已足够
预期结果: 一份有优先级的分析计划,说明每步决策依据。
失败处理: 若决策树无法适用(如完全未知的天然产物),则采用全套谱学方法,确保覆盖所有信息维度。
第 5 步:撰写分析计划报告
输出结构化的分析计划:
## 谱学分析计划 ### 样品信息 - 编号:[样品 ID] - 来源:[合成 / 天然 / 未知] - 可用量:[mg] - 已知信息:[分子式、合成路线等] ### 分析目标 [结构鉴定 / 身份确认 / 纯度 / 定量] ### 推荐技术序列 | 步骤 | 技术 | 预期获取信息 | 样品消耗 | 预计时间 | |-----|-----|-----------|---------|---------| | 1 | [技术] | [信息] | [mg] | [时间] | ### 决策节点 - 若步骤 1 显示 [结果],则进行步骤 2 - 若步骤 2 显示 [结果],则不需要步骤 3 ### 总计 - 总样品消耗:[mg] - 预计总时间:[小时]
预期结果: 一份完整的分析计划,可直接传达给仪器操作员或实验室记录。
失败处理: 若样品量不足以支持全套方案,在报告中注明所有假设,并列出可能无法完全鉴定时的备选策略。
验证清单
- 分析目标已明确分类(鉴定/确认/纯度/定量)
- 样品量约束已评估,排除了不可行的技术
- 所选技术之间具有互补性(避免重复信息的冗余技术)
- 技术序列按"无损先行、信息量优先"排列
- 每步决策节点已明确(何时停止,何时追加实验)
- 总样品消耗和时间在实际约束范围内
- 计划已记录,可重现
常见问题
- "全套谱学"思维陷阱:不加区分地采集所有谱图浪费样品和仪器时间。应先根据目标筛选,只采集必要的谱图。
- 忽视样品稳定性:热不稳定或对光敏感的样品需避免高温电离(EI)或长时间光照(UV-Vis)。应在分析计划中注明样品的稳定性要求。
- NMR 溶剂选择不当:在 CDCl3 中不溶的化合物强行溶解会导致谱图质量差。应先做溶解度筛查,选择合适的氘代溶剂。
- 过早进行二维 NMR:若一维 NMR 已可完成鉴定,不必采集耗时的二维谱。先仔细分析一维谱,再决定是否需要二维实验。
- 不记录分析计划:临时决定采集哪些谱图导致分析路径不可重现。应在开始前制定并记录完整计划。
- 忽视仪器校准状态:使用未校准(锁场未正常/匀场差)的 NMR 仪器得到的数据质量差,导致错误结论。开始分析前确认仪器工作状态。
相关技能
— 执行 NMR 谱解读interpret-nmr-spectrum
— 执行 IR 谱解读interpret-ir-spectrum
— 执行 MS 谱解读interpret-mass-spectrum
— 执行 UV-Vis 谱解读interpret-uv-vis-spectrum
— 执行拉曼谱解读interpret-raman-spectrum